El Programa de Doctorado en Biotecnología Molecular está destinado a graduados con grado académico de licenciado o grado de magíster de especialidades afines, como biólogos, bioquímicos, químicos-farmacéuticos, bioingenieros, biotecnólogos e ingenieros químicos, y se propone proveer de conocimientos avanzados para aplicar e innovar en los aspectos biológicos que abarca la biotecnología moderna. Además se consolidan otros aspectos muy relevantes en la industria biotecnológica como son las políticas regulatorias y de patentamiento y su consecuencia en la sociedad. La creación del programa tiene como base el rápido crecimiento del número de bioproductos y su uso expandido que han hecho que la industria biotecnológica crezca exponencialmente a nivel mundial. Específicamente la producción de biomoléculas se está convirtiendo en una opción de tratamiento para pacientes con enfermedades prevalentes. Además, es reconocido el gran impacto que ha tenido la generación y aplicación de biomoléculas en el sector agropecuario para combatir patógenos que atacan tanto a plantas como a animales. La industria también ha sido beneficiada con el desarrollo de la biotecnología mediante el desarrollo de enzimas que inciden directamente en el aumento del rendimiento de los procesos productivos.