En este curso se estudiarán algoritmos de búsqueda exhaustiva para encontrar secuencias repetidas como motivos o en el mapeo de ADN.

La programación dinámica se utilizará para analizar las alineaciones locales y globales de las secuencias de aminoácidos y nucleótidos en función de los cálculos de similitud o distancia. Se realizará una aproximación de aprendizaje automático con modelos ocultos de Markov. Además, en la búsqueda de secuencias reguladoras de genes, estructuras cruciales en epigenética, las islas CpG necesitan del HMM con los algoritmos de decodificación de Viterbia y Baum-Welch. Asimismo, este curso también incluirá modelos estocásticos y log odd ratio.